崇左幼儿师范高等专科学校前身是创建于1982年8月的南宁地区教师进修学校，坐落于南宁市北湖北路57号。
1984年2月，经广西壮族自治区人民政府批准，南宁地区教师进修学校更名为南宁地区教育学院，隶属自治区教委和南宁地区行署双重领导。
1986年3月，经国家教委备案，南宁地区教育学院正式列入全国成人高等院校系列，并分别于1988年、1994年通过自治区教委和国家教委的评估验收。
1992年3月，学院改由南宁地委、南地行署直接领导。
1999年7月，“南宁地区教育学院”与“南宁地区电大分校”正式合并，集成人高等教育、普通高等教育和电大开放教育，组成新的南宁地区教育学院，这标志着学院的发展进入一个崭新的阶段。
2003年，撤销南宁地区并设立地级市崇左市后，学院隶属于崇左市人民政府。
2012年9月，学院整体搬迁至崇左市办学，校园坐落于崇左市建设路32号。
2017年6月，学院整体搬迁至崇左市江州区佛子路37号东盟校区过渡办学。
2018年9月，学院已搬迁至崇左市江州区崇善大道55号新校区办学。
2019年3月，经广西壮族自治区人民政府批准并报教育部备案，南宁地区教育学院改制更名为崇左幼儿师范高等专科学校。
2020年8月31日，崇左幼儿师范高等专科学校与崇左职业技术学校正式举行两校融合办学挂牌仪式，实施中职、高职教育有效衔接与合作发展。
2020年12月15日，从《崇左市人力资源和社会保障局关于公布2020年崇左市级高技能人才培训基地和技能大师工作室建设项目的通知》文件获悉，我校被确定为崇左市级高技能人才培训基地建设项目。
2020年12月20日，我校成功申报崇左市少数民族传统体育竞技项目基地。
2022年9月28日，崇左幼儿师范高等专科学校附属幼儿园正式揭牌。
