1949年蚌埠市立工人联合医院附设护士学校创建。

1953年蚌埠市立工人联合医院附设护士学校更名为安徽省蚌埠护士学校。

1958年安徽省蚌埠护士学校更名为安徽省蚌埠卫生学校。

1969年安徽省蚌埠卫生学校更名为宿县地区卫生学校。

1998年宿县地区卫生学校更名为宿州卫生学校。

2006年，学院搬入新校区。

2014年5月，学校顺利通过国家教育部正式备案，正式成为专科层次的皖北卫生职业学院。

2021年7月，学院通过教育部高等职业院校人才培养工作评估。

2022年2月，学院获批安徽省地方技能型高水平大学的立项建设单位