1958年5月5日，红河州卫生学校筹备小组成立。

1958年9月，红河卫校宣告成立，校址设在原蒙自专署公安处及原红河州合作办事处。

当年招收护士、医士两专业学生259人。

1958年10月26日，红河卫校举行开学典礼，27日正式上课。

1963年8月，红河卫校搬到南湖边校址。

1996年，被云南省人民政府批准为省部级重点中专。

2001年，被国家教育部批准为国家级重点中专。

2012年2月，云南省人民政府批准同意在红河州卫生学校的基础上组建红河卫生职业学院，

同时撤销红河州卫生学校建制；2012年4月，教育部审批备案。

2012年5月9日，红河卫生职业学院正式挂牌成立。

2012年7月，学院新校区建设项目动工，新校区校址在小新寨水库旁。

2015年9月，红河卫生职业学院整体搬迁至占地600余亩的新校区办学。

2015年9月29日，《红河卫生职业学院章程》通过省教育厅核准。

2015年12月，学院通过云南省教育厅人才培养工作合格评估。

2018年，学院内部质量保证体系（2016-2018）通过了省教育厅的复核。

章程明确每年的10月26日为红河卫生职业学院校庆日。