学院的前身是创建于上世纪50年代—70年代的阿克苏地区农业学校、卫生学校、农业机械学校、文化艺术学校、财贸学校、体育运动学校六所中等专业学校，办学50余年来，学院经历了44年中等专业学校的艰苦创业，取得了辉煌的办学成就，经过8年以来的并校合院建设历程，学院的改革与发展都取得了长足的进步。学院是教育部等国家六部委指定的西北五省唯一的护理专业技能型紧缺人才示范性培养培训基地、新疆第一职教园区特色林果业示范培训中心，国家第六职业技能鉴定所。阿克苏职业技术学院在上海市、河南省、浙江省对口支援的几年中，学院的教育教学、行政管理、基本建设、在校生规模等各个方面都取得了骄人的成绩，2008年以优秀成绩通过教育部人才培养工作水平评估；2010年成功申报自治区示范性高职院校，跻身于先进高职院校行列。在新的发展阶段，学院以中央新疆工作会议精神为契机，积极筹划落实浙江省对口支援阿克苏地区工作的目标、任务,把握机遇，推进学院实现跨越式发展。学院以创建自治区示范高职院校为目标，不断探索新的人才培养模式改革，步入了一个科学发展、改革创新的新阶段。